引起血小板减少的原因很多，然而从其发病机制来说，血液分析仪厂家认为一般可分为三大类：
(1)血小板生成减少：血小板是由骨髓中巨核细胞产生，凡可影响到骨髓中巨核细胞生成的因素均可造成血小板生成减少。如骨髓造血干细胞质或（和）量的异常所造成的再生障碍性贫血；各种恶性肿瘤对骨髓浸润，替代正常造血组织；有些细菌、病毒（如乙肝病毒）感染，以及电离辐射（如X射线、7射线）对骨髓造血干细胞造成损伤，影响其在骨髓中增生，均可引起血小板减少。某些药物（如苯、二甲苯、抗肿瘤化疗药物、有机砷）可引起骨髓造血低下，而有些药物（如氯噻嗪类、雌激素、乙醇等）选择性抑制巨核细胞生成血小板，最终导致血小板生成减少。这些因素多数可影响多个造血细胞系统，常伴有不同程度的贫血，白细胞减少。
(2)血小板破坏过多：血小板的生成及代谢在体内是相对平衡的，但在有些疾病如特发性血小板减少性紫癜及药物免疫性血小板减少性紫癜，由于患者体内产生针对自身血小板的抗体，这些抗体与血小板结合并使血小板致敏，导致致敏的血小板在单核巨噬细胞系统被吞噬破坏。而有些疾病如弥散性血管内凝血、血栓性血小板减少性紫癜等，则是由于血管内有大量的微血栓形成，造成血小板在体内被大量消耗。如果机体在这些情况下，血小板生成不能完全代偿时，最终造成血小板减少。
(3)血小板分布异常：血小板的正常寿命为9-11天，若由于失血而输注大量缺少血小板的库血，则引起分布异常所致的血小板减少，血小板减少程度与输入库血量呈负相关。此外，脾脏是人体内血小板分布最多的脏器，当各种原因如肝硬化、骨髓纤维化等造成脾肿大及脾功能亢进时，大量血小板储存在脾脏内，也会引起外周血小板减少。
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